Сын местного кантора Венцеля Микша. С 1778 г. пел в церковном хоре в Дрездене. Учился пению у Людвига Корнелиуса и композиции у Йозефа Шустера и в 1783 г. занял должность придворного певца. После дополнительных занятий с болонским певцом-кастратом Винченцо Казелли Микш в 1797 г. дебютировал в дрезденской Итальянской опере. С 1801 г. он преподавал в Дрезденской капелле мальчиков. В 1820 г. Микш возглавил хор Дрезденской оперы, которой в то время руководил Карл Мария Вебер. В 1824 г. он был назначен хранителем королевской музыкальной библиотеки. В 1831 г. Микш вышел на пенсию.
В композиторском наследии Микша преобладает церковная музыка, арии и песни. Однако наиболее значителен он как педагог. Учениками Микша были Франческо Ламперти, Антон Миттервурцер, Густав Вильгельм Тешнер, Вильгельмина Шрёдер-Девриен, Фридрих Вик и его дочь Клара Шуман, Агнес Шебест и другие крупные певцы и музыкальные педагоги.
