Получил начальное музыкальное образование в Роттердаме как пианист (занимался в том числе у Вольдемара Баргиля) и скрипач. Играл на альте в нескольких нидерландских оркестрах, с 1876 г. выступал с сольными фортепианными концертами, в 1879—1885 гг. преподавал фортепиано в музыкальной школе. Одновременно в 1879—1887 гг. был ассистентом своего отца, Виллема Хютсенрёйтера, в оркестре Роттердамской гильдии стрелков. В 1881 г. опубликовал первое собственное сочинение для фортепиано.
В 1890 г. Хютсенрёйтер был принят вторым дирижёром в амстердамский оркестр Концертгебау, руководимый Виллемом Кесом. Одновременно он работал с оркестрами в Роттердаме и Утрехте и в 1894 г. стал первым руководителем Утрехтского муниципального оркестра. Эпоха Хютсенрёйтера в Утрехте ознаменовалась значительными успехами, вершиной которых стала мировая премьера Шестой симфонии Густава Малера 27 мая 1906 г. на фестивале Немецких музыкальных обществ в Эссене, под управлением автора; позднее Хютсенрёйтер опубликовал об этом событии мемуарный очерк. В репертуаре оркестра важное место занимала и другая новейшая музыка — в том числе произведения Рихарда Штрауса и Макса Регера. В 1896 г. Хютсенрёйтер опубликовал в газете «Nieuwe Rotterdamsche Courant» отчёт о постановке вагнеровского «Кольца Нибелунгов» в Байройте, в 1898 г. выпустил первую в Нидерландах книгу о Рихарде Штраусе, за которой последовали биографии Моцарта, Малера, Вагнера, Брамса и Шуберта (последняя вышла посмертно).
С 1917 г. Хютсенрёйтер руководил музыкальной школой в Роттердаме, посвящая много времени музыковедческим сочинениям. Были опубликованы его книги «История оркестра и его инструментов» (нидерл. De geschiedenis van het orkest en van zijn instrumenten; 1926); «Симфонии Бетховена» (1928), «Сонаты Бетховена» (1930) и др., а также мемуары «Консонансы и диссонансы» (нидерл. Consonanten en dissonanten. Mijn herinneringen; 1930). Среди музыкальных произведений Хютсенрёйтера — фортепианный концерт (1883), оркестровая сюита (1889), скрипичная и виолончельная сонаты, фортепианная музыка.
