Происходил из дворян Херсонской губернии, родился 6 декабря 1824 г. По окончании курса в 1-м кадетском корпусе, выпущен был 2 августа 1843 г. прапорщиком в 13-ю артиллерийскую бригаду и в 1848—1849 г. принял участие в Венгерской кампании, обратив тогда же на себя внимание выдающимися боевыми способностями.
Награждённый за сражение с венграми 11 июля 1849 г. чином штабс-капитана и австрийским орденом Железной Короны 3-й степени, Похитонов по окончании кампании был переведён на Кавказ, где продолжал дальнейшую боевую службу в Гурийском отряде и неоднократно бывал в делах против горцев и во время Восточной войны сражался с турками.
В 1861 г. произведён в подполковники, с назначением командиром 5-й батарей 9-й артиллерийской бригады, а в 1864 г. определен был плац-майором Киево-Печерской цитадели, где и оставался до 1869 г., когда, произведённый в следующий чин, вновь возвращён к строевой службе и назначен командиром 5-й артиллерийской бригады. В 1870 г. за беспорочную выслугу 25 лет в офицерских чинах награждён орденом св. Владимира 4-й степени с бантом.
Получив 30 августа 1875 г. чин генерал-майора, Похитонов принял участие в русско-турецкой войне 1877—1878 гг. и за успешное действие вверенной ему бригады при взятии Никополя получил 16 июля 1877 г. орден св. Георгия 4-й степени
Участвуя в боях под Плевной и при переходе Араб-Конакского перевала, Похитонов в 1878 г. награждён был за боевые отличия золотым оружием с надписью «За храбрость» и в 1879 г. — орденами св. Станислава 1-й степени с мечами и св. Анны 1-й степени с мечами. Вскоре после окончания русско-турецкой войны Похитонов был назначен начальником артиллерии 2-го Кавказского корпуса, а в 1881 г. — начальником артиллерии Гренадерского корпуса, в 1883 г. награждён орденом св. Владимира 2-й степени и 30 августа 1885 г. произведён в генерал-лейтенанты.
В следующем году в лагере при с. Клементьеве он упал с лошади и, после безуспешного лечения, вынужден был оставить службу; перечисленный в 1888 г. в запас полевой пешей артиллерии, Похитонов 17 сентября 1889 г. скончался в Москве.
