Происходил из Рима. Как и его предшественники, был избран при поддержке Альбериха II. В период понтификата не вмешивался в политику, занимаясь исключительно церковными делами. Будучи приверженцем Клюнийской реформы, продвигал её в римских и италийских бенедиктинских монастырях. Сохранилось два послания Марина II.
В некоторых средневековых источниках именуется не Марином II, а Мартином III. Те же источники именуют папу Марина I Мартином II. Это внесло ошибку в перечень римских понтификов с именем Мартин: после Мартина I следующий римский папа, принявший это имя, именовался Мартином IV.
