Родом из знатной ирландской фамилии. В 1793 году командовал авангардом рейнской армии, но вскоре как дворянин был заключён под стражу. Освобождённый по завершении террора, Кларк в 1796 году был послан Директорией в Италию для наблюдения за Бонапартом, но свою задачу не выполнил, так как полностью подчинился его влиянию.
Во время пребывания Бонапарта в Египте Кларк жил в стороне от дел, пока ему не было поручено заключение союза с сардинским королём. В сентябре 1800 года Бонапарт послал его в Люневиль для ведения мирных переговоров. Во время войны с Австрией (1805) император поручил Кларку управление Веной, в 1806 году — Берлином, а в 1807 году назначил его военным министром. В 1814 году Кларк был одним из первых, изменивших Наполеону и подавших голос за его низложение. В 1815—1817 годах Кларк вновь занимал должность военного министра.
