Родился 24 апреля (6 мая) 1824 года. Воспитывался в Школе гвардейских подпрапорщиков и кавалерийских юнкеров.
Службу начал 2 августа 1843 года прапорщиком лейб-гвардии Измайловского полка, с которым в 1849 году участвовал в Венгерском походе.
В 1862 году Аллер был назначен командиром 6-го Таврического гренадерского полка, во главе которого принял деятельное участие в усмирении польского восстания 1863 года.
В 1865 году назначен командиром Санкт-Петербургского гренадерского (впоследствии лейб-гвардии) короля Фридриха Вильгельма III полка. 30 августа 1866 года произведён в генерал-майоры, в 1869 году награждён орденом св. Станислава 1-й степени. В 1871 году получил орден св. Анны 1-й степени, а затем ему дано было почётное поручение принести поздравления германскому императору Вильгельму I по случаю окончания франко-прусской войны.
В 1873 году принял командование 32-й пехотной дивизией, 30 августа 1876 года произведён в генерал-лейтенанты. Во главе своей дивизии участвовал в турецкой войне 1877—1878 годов.
За труды и «отличное мужество», оказанные в эту кампанию, Аллер был награждён орденами св. Владимира 2-й степени с мечами (1878) и Белого Орла с мечами (1880).
По окончании войны до 1888 года командовал 7-м армейским корпусом, а затем назначен членом Военного совета. В 1883 году был удостоен ордена св. Александра Невского.
В 1890 году Аллер был произведён в генералы от инфантерии.
Умер 28 июня (10 июля) 1895 года. Похоронен на Волковском лютеранском кладбище в Санкт-Петербурге.
