Вскоре после этого она покинула замок бургундских Лалаингов и переехала к своему дяде по материнской линии жившему неподалеку от Ауденарде. В июле 1522 г. Иоханна родила дочь, которая была названа Маргаритой, в честь Маргариты Австрийской, тетки Карла.
Через два года после рождения дочери она вышла замуж за Жана ван ден Дейке и родила тому девять детей. Маргарита начиная с 1531 года воспитывалась в Брюсселе при дворе своей тетки Марии Австрийской, бывшей штатгальтером испанских Нидерландов.
