Из за связей с противником царской власти Кваркваре II Джакели в 1462 году царь Грузии Георгий VIII лишил Баграта VI власти в Кутаиси, Имеретии. Но Баграт восстал против действий Георгия и в 1463 году в бою при Чирохи одолел Георгия VIII и объявил себя царем Имеретии.
В 1465 году воспользовавшись тем что Кваркваре II Джакели пленил Георгия VIII перешел в Картли и в 1466 году объявил себя царем Грузии.
В 1477 году в Грузию вошла Иранская армия под предводительством Узун-Хасана, которая заняла Тбилиси, Гори и всю картлийскую низменность. Баграт VI подписал договор, а также заплатил дань, но вскоре после смерти Узун-Хасана в 1478 году враг оставил Грузию.
