В 2007 году выступил против Акта о каноническом общении РПЦЗ и РПЦ МП и перестал подчиняться Синоду РПЦЗ, вместе с рядом поддержавших его клириков образовал «Временное высшее церковное управление РПЦЗ» и был избран его председателем. За раскольническую деятельность лишён священного сана Архиерейским собором РПЦЗ МП в 2009 году. Запрещения не признал. Свою юрисдикцию он считает настоящей РПЦЗ, а епископов, клириков и мирян, признавших «Акт о каноническом общении» — ушедшими в раскол.
Биография
До архиерейства
Состоял в комсомоле. Окончил Одесский педагогический институт. Был женат. Работал художником. Имеет дочь 1984 года рождения. Позднее развёлся с женой, которая уехала на постоянное место жительства в Израиль.
В начале 1990-х годов, после безуспешных попыток получить сан в МП, примкнул к РПЦЗ.
31 августа 1991 года принял монашество с именем Агафангел в честь новоисповедника святителя Агафангела (Преображенского), митрополита Ярославского (память — 3 октября по юлианскому календарю).
1 сентября 1991 году рукоположён в сан диакона; 8 сентября — священника в Москве в катакомбном домовом храме свв. Новомучеников и Исповедников Российских архиепископом Тамбовским и Моршанским Лазарем (Журбенко).
Окормлял общину в Ивано-Франковске. В 1992 году стал настоятелем храма свв. Николая и Ариадны (ныне — прав. Иоанна Кронштадтского) в Одессе.
Архиерейство
27 марта 1994 года в Цареконстантиновском соборе Суздаля без согласования с архиерейским Синодом РПЦЗ хиротонисан во епископа Симферопольского двумя отправленными на покой за уход в раскол архиереями РПЦЗ: архиепископом Лазарем (Журбенко), епископами Валентином (Русанцовым) и рукоположённым ими Феодором (Гинеевским).
Хиротония Агафангела первоначально не была признана РПЦЗ. Для удостоверения в благонадёжности Агафангелу и другим рукоположённым без согласия с синодом РПЦЗ им было предложено признать справедливым осуждение Лазаря (Журбенко) и Валентина (Русанцова), а также на протяжении длительного испытательного срока проживать в США под контролем епископов РПЦЗ. Агафангел (Пашковский), единственный согласившийся на эти условия, в течение девяти месяцев проживал в Соединенных Штатах, после чего был утверждён в 1996 году в архиерейском звании и получил титул «епископ Симферопольский и Крымский».
В 2000 году после ухода на покой Митрополита Виталия, сначала поддержал архиепископа Лазаря (Журбенко), заявившего об административном отделении от РПЦЗ.
Тем не менее, на Архиерейском Соборе 2001 года епископ Агафангел поддержал избрание Лавра (Шкурлы) Первоиерархом РПЦЗ.
С 17 декабря 2003 года — епископ Одесский и Таврический, управляющий Запорожской епархией РПЦЗ.
В декабре 2006 года епископ Агафангел был обвинён своим бывшим клириком архимандритом Вениамином (Трепалюком) в работе на ЦРУ: согласно архимандриту Вениамину, Агафангел испытывает «антагонистическую ненависть к России, к её властям, народу», зато ЦРУ считает «самой гуманной организацией в мире», которая «заботится о благе своего народа».
Оппозиция Акту о каноническом общении РПЦЗ и РПЦ
В октябре 2006 года Епископ Агафангел, согласно сообщениям некоторых СМИ, якобы заявил: «Я не признаю подписанного Синодом документа об утверждении Акта о каноническом общении»; 16 октября сообщение было опровергнуто самим епископом. Агафангелом: «Мы не отделяемся от Архиерейского Синода, возглавляемого нашим Первоиерархом, митрополитом Лавром… Только ради того, чтобы наш голос был услышан, мы предприняли крайнюю меру — до времени воздерживаться от возношения имени Первоиерарха на богослужениях»