В 1704 году назначен начальником галерного флота, который устраивался тогда в Петербурге и Кронштадте. В 1705 году содействовал Брюсу (обер-коменданту Петербурга) прогнать шведского генерала Майделя от строившегося тогда Петербурга.
В 1708 году граф Боцис нечаянно и удачно напал на финляндский берег, разорил город Борг, собрал контрибуцию с окрестных сел, истребил неприятельский отряд и сжег 15 купеческих судов. В августе того же года снова защищал Петербург от шведского генерала Любекера.
В 1710 году участвовал в ледовом походе к Выборгу, возглавляя галерный отряд, затем участвовал в осаде Выборга. В августе 1712 года под начальством Апраксина, по дороге к финскому местечку Вогеласко, завладел шведской эскадрой из 6-ти военных судов.
В 1713 году командовал арьергардом флота, в котором Петр предводительствовал авангардом и который вез в Финляндию сухопутные войска генерал-лейтенанта князя Голицына. Петр Великий находился в переписке с графом Боцисом, которого ценил за его знания и личные достоинства; по смерти Боциса, царь взял на память его шпагу и обеспечил пенсиею его семейство. Во время бракосочетания Екатерины с Петром Боцис был посаженным отцом царя вместе с вице-адмиралом Крюйсом.
