Принадлежал к так называемому «арефьевскому кругу» — группе ленинградских художников-нонконформистов рубежа 1950-60-х гг., неформальным лидером которой был Александр Арефьев. Был исключен из Средней художественной школы при Ленинградской Академии художеств. Играл на гитаре и контрабасе в оркестре народных инструментов, работал электромонтажником, грузчиком, раскройщиком полиэтилена, в 1961—1968 гг. находился на принудительном лечении в психиатрической больнице.
Работы Владимира Шагина находятся в Третьяковской галерее, Русском музее, парижском Центре Помпиду и др.
