Фридрих Август был шестым ребёнком в семье Кристиана Августа Шлезвиг-Гольштейн-Готторпского (1673—1726) и Альбертины Фридерики Баден-Дурлахской. 21 ноября 1752 года он женился на Ульрике Фридерике Вильгельмине Гессен-Кассельской.
В 1750 году Фридрих Август наследовал Любек своему брату, который через год должен был стать королём Швеции.
После смерти Фридриха Августа в 1785 году герцогством за душевнобольного сына Фридриха Августа Петера Фридриха Вильгельма управлял его племянник Петер Фридрих Людвиг Ольденбургский, сын Георга Людвига.
У Фридриха Августа было трое детей:
