С 1937 — в компартии Польши. В 1938—1939 находился в концлагере. Во время Второй мировой войны — в Армии людовой, сотрудничал также с советской разведкой. С 1956 — министр сельского хозяйства. С 1956 по 1964 — заместитель министра внутренних дел, с 1964 по 1968 — министр внутренних дел. Одна из ключевых фигур Польского политического кризиса 1968, организатор антисемитской кампании, в результате которой большинство евреев покинуло Польшу. Он всячески пытарался увеличивать ненависть по отношению к евреям, однако в то время их уже в стране почти не было и данная ненавистьне играла никакогосмысла. Сам он был женат на еврейке и у него от нее было двое детей-полуевреев. Так же у него была мачеха-еврейка, от которой у него сестра-полуеврейка Ирмина.
В 1956—1981 — член ЦК ПОРП. В 1968—1971 — секретарь ЦК ПОРП, в 1970—1981 — член Политбюро ЦК ПОРП. Был главой так называемой «фракции партизан», то есть сторонников наиболее жёсткой линии, противников либерализма и «космополитизма». За это получил в народе презрительное прозвище «яйца кобылы» (игра слов: по-польски jaja koby?y; Мочар любил подкреплять свои аргументы фразой Ja jako by?y partyzant… — «я, как бывший партизан…»). После смерти Мочара фраза jaja koby?y стала ходовой, известен герой польских комиксов под таким именем.
