Семья
Родился в семье протоиерея Василия Кузьмича Аметистова, служившего в городе Боброве Воронежской губернии. В семье было восемь детей — шестеро дочерей и двое сыновей. Внук Евгения Аметистова — судья Конституционного суда Эрнест Аметистов.
Священник и обновленец
Окончил Воронежскую духовную семинарию (1906), служил псаломщиком в Николаевской церкве станицы Усть-Лабинской на Кубани. Женился на Александре Ивановне. В 1907 рукоположён во диакона, затем во иерея к Михаило—Архангельскому собору города Темрюка. Затем четверть века служил в церквях различных кубанских станиц и города Краснодара.
Присоединился к обновленческому движению в 1922. В 1926 был назначен Кубанским областным «благовестником», с 1930 — членом обновленческого Кубанского епархиального управления. С 31 декабря 1933 — епископ Карельский (хиротонисан в брачном состоянии), с декабря 1935 — архиепископ.
Арест и гибель
16 января 1938 был арестован, обвинён в участии в контрреволюционной организации. На первом допросе виновным себя не признал, на втором допросе изменил показания, признавшись в работе на деникинскую контрразведку, спецслужбы Германии и Финляндии — последним он якобы выдавал сведения «о длине русла, ширине и глубине рек Неглинки и Лососинки, о мостах через эти речки в гор. Петрозаводске», «о мощности хлебозаводов», «о местонахождении почты, телеграфа и больниц города».
Судья Эрнест Аметистов, ознакомившийся с делом своего деда, писал:
13 февраля 1938 осуждён к расстрелу Комиссией НКВД и Прокуратуры СССР. 4 марта того же года расстрелян. В 1959 реабилитирован.
