В 1927 году за отказ присоединиться к обновленцам был распоряжением ОГПУ посажен во Владивостокскую тюрьму, где пробыл 18 дней.
В августе того же года за преподавание Закона Божия опять посажен в тюрьму, где содержался 14 дней.
В 1928 году был выслан из Владивостокской епархии за то же самое.
В том же году за неприсоединение к обновленцам выслан из Благовещенской епархии, а в 1930 году без предъявления обвинения отправлен на лесные принудительные работы.
В 1931 году был принят проживавшим в Харбине архиепископом Камчатским Нестором под свой омофор и назначен священником при церкви «Дома Милосердия» в Харбине.
В 1934 году, по личному предложению владыки Нестора, священник Василий стал настоятелем русской православной общины в Батавии (ныне Джакарта) на острове Ява и вошёл в ведение Харбинской епархии. По приезде на Яву отцу Василию пришлось вновь организовать православный приход и устроить церковь в Бандунге. Здесь он служил в сане священника, а в октябре 1947 года был возведён в сан протоиерея.
В конце 1940-х годов приход на Яве стал подчиняться архиепископу Сан-Францисскому Тихону. В новых условиях начался спешный разъезд русских из обретшей независимость Индонезии. В мае 1950 года отец Василий писал владыке Тихону что,
