Биография
Воспитанник футбольного куба «Флуминенсе», в котором он начал профессиональную карьеру. В 2005—2006 гг. выступал за мексиканский клуб «Сантос Лагуна», а затем а «Ботафого» из Рио-де-Жанейро.
В 2007 году возвратился в родной «Флуминенсе», став твёрдым игроком основы и выиграл с клубом Кубок Бразилии. В 2008 году впервые в истории «Флуминенсе» дошёл до финала Кубка Либертадорес. По окончании чемпионата Бразилии 2008 18 декабря было объявлено о переходе Жуниора Сезара в стан действующего чемпиона страны «Сан-Паулу».
Достижения
- Кубок Бразилии (1): 2007
- Лига Кариока (2): 2002, 2006
- Финалист Кубка Либертадорес (1): 2008