Поступив на службу в 1791 году, он уже в 1796 году за отличие в итальянских походах, особенно в сражении при Риволи, был произведён в дивизионные генералы.
В 1797 году, командуя отдельным корпусом, он успешно действовал в Тироле, затем присоединился к войскам Бонапарте в Виллахе и этим маневром способствовал заключению Кампоформийского мира.
В 1799 году Директория назначила Жубера главнокомандующим французской армией в Италии, где в это время действовала русско-австрийская армия под начальством Суворова. Желая воспользоваться предполагаемой рассредоточенностью войск союзников, Жубер немедленно перешёл в наступление, но при городе Нови неожиданно наткнулся на армию Суворова и в самом начале сражения был убит. По отзыву Наполеона:
