Родился 11 декабря 1962 года в Москве. С отличием окончил Московский Государственный институт международных отношений МИД СССР. В течение продолжительного времени работал в Центральном аппарате и загранпредставительствах МИД СССР.
С 1993 года занимал руководящие посты в ряде нефтяных компаний: заместитель генерального директора ЗАО «ЕнисейНефть» (1993—1995 гг.), вице-президент ЗАО «Росинвестнефть» (1995—1998 гг.), коммерческий директор ЗАО «Батумский нефтяной терминал» (1998—2000 гг.). Два года был вице-президентом ЗАО «Центр Инвестиционных проектов и программ».
8 июля 2002 года вступил в должность генерального директора ООО "Мострангаз", был в должности до 20 ноября 2011 года.
В декабре 2011 года назначен заместителем гендиректора "Газпром экспорта" по работе с Еврокомиссией.
13 октября 2004 года на Алексея Сергеевича Голубничего было совершено покушение. . Оданако по версии Голубничего и его помощников он не мог быть объектом покушения.
