Преподаватель медико-биологического факультета (МБФ) 2-го Московского медицинского института им. Н. И. Пирогова с 1965 по 1968 год. Аспирант, а затем младший научный сотрудник Института электронных управляющих машин МИНприбора СССР с 1969 по 1972 год.
В 1973—1978 годах — старший научный сотрудник ВНИИ генетики промышленных микроорганизмов Главмикробиопрома СССР.
Ведущий научный сотрудник Института истории естествознания и техники РАН (Москва), где работает с 1980 года. Автор 190 публикаций, среди которых широко известные монографии «Элементы эволюционной диатропики» (1990), «О природе случайности» (2001, 2004), «Эволюция» (2003), «Наука о развитии жизни» (2006), «Активный связный мир» (2008).
Основные печатные работы Ю.В. Чайковского
Обозначения изданий: БПС – Биология (газета, с 2010 журнал) издат. дома «Первое сентября»; БШ – Биология в школе (ж-л); ВИЕТ – Вопросы истории естествознания и техники (ж-л); ВФ – Вопросы философии (ж-л); ЗС – Знание – сила (ж-л); ЛЧ - Любищевские чтения. Ульяновск (ежегодник); ХЖ – Химия и жизнь (ж-л).
Книги
- Элементы эволюционной диатропики. М., Наука, 1990. 271 с., именной указатель.
- О природе случайности. М., Центр системных исслед., 2001 . 271 с. (Изд. 2, исправленное и дополненное; там же, 2004. 278 с., указатели)
- Эволюция. Книга для изучающих и преподающих биологию. М.,Центр системных исслед., 2003. 472 с., указатели.
- Наука о развитии жизни. Опыт теории эволюции. М., КМК, 2006. 712 с., указатели.
- Активный связный мир. Опыт теории эволюции жизни. М., КМК, 2008. 725 с., указатели.
- Зигзаги эволюции. Развитие жизни и иммунитет. М., Изд. Наука и жизнь, 2010. 110 с.
- Диатропика, эволюция и систематика. К юбилею Мейена. Сб. статей. М., КМК, 2010. 407 с.
Основные статьи
- О непрерывном процессе решения матричных игр // Доклады АН СССР, 1971, т. 199, № 5, с. 1026-1028. Примеч.: на с. 1027 номера формул спутаны с номерами из списка лит-ры.
- On a continuous process of matrix game solution // Soviet Math. Dokl., 1971, vol. 12, N 4, с. 1245-1247.
- Изумительная асимметрия // ЗС, 1981, № 2, c. 16-18, 48.
- Экстремальность как междисциплинарная эвристика // Взаимодействие наук как фактор их развития. Новосибирск, Наука, 1988, с. 86-106.
- Алеатика – наука о случайности // Ценологич. исслед-ния, вып. 1. Абакан, 1996, с. 42-63.
- Что такое случайность? // Электрика, 2001, № 10, c. 32-41 Примеч.: также отд. брошюра, 16 с., ред. ж-ла «Электрика», 2001.
- Что такое вероятность? Эволюция понятия (от древности до Пуассона) // Историко-математич. исследования, 2001, вып. 6 (41), с. 34-56.
- Проблема наследования и генетический поиск (описание проблемы и простейший пример поиска) // Теоретич. и эксперимент. биофизика. Межвузовский сб., вып. 6. Калининград, 1976, с. 148-164.
- Выживание мутантного клона. Сообщ. 1, 2 // Генетика, 1977, т. 13, № 8.
- Генетическая интеграция клеточных структур как фактор эволюции // Журнал общей биол., 1977, т. 38, N 6, c. 823-835.
- Новое в проблеме факторов эволюции организмов // Диалектика развития в природе и научном познании. Сб. обзоров. М, ИНИОН, 1978, с. 88-134.
- (Совместно с Г.Г. Маленковым) Выживание мутантного клона. Сообщ. 3. Катастрофический отбор. // Генетика, 1979, т. 15, № 10, c. 1809-1815.
- Как клетки научились делиться // ЗС, 1979, № 6
- (Совместно с С.В. Мейеном) О работах А.А. Любищева по общим проблемам биологии // *Любищев А.А. Проблемы формы, систематики и эволюции организмов. М., Наука, 1982, с. 5-23.
- To the evolutionary thermodinamics // Lectures in theoretical biology. Tallinn, 1988, c. 65-72.
- К общей теории эволюции // Путь. Междунар. философский ж-л, 1993, № 4, с. 101-141.
- Об эволюционных взглядах Карла Поппера // ВФ, 1995, № 12, с. 50-54.
- Ступени случайности и эволюция // ВФ, 1996, № 9, с. 69-81.
- Макросистема и эволюция // БШ, 1999, № 4, с. 9-14.
- Юбилей загадки [ископаемые мозги] // БПС, 2000, № 32, c. 14-16.
- Эволюция: с чем входим в новый век? // БШ, 2001, № 1, c. 9-14.
- От происхождения видов к эволюции живой природы. Контуры новой теории эволюции // Домашний лицей, 2001, № 2, c. 49-57, № 3, с. 99-106.
- Ламаркизм умер. Да здравствует ламаркизм // ВИЕТ, 2002, № 3, с. 430-447.
- Иммунитет и эволюция: не впасть бы в другую крайность // Вестник РАН, 2003, № 3, с. 265-273.
- Что такое молекулярный ламаркизм // БПС, 2003, вып. 31, с. 3-13.
- Идея отбора опровергнута опытом. Что движет эволюцию? // ЛЧ, 2006, с. 104-114.
- От жажды умираю над ручьем, или Новое в теории эволюции // Наука и жизнь, 2007, № 2, с. 38-44.
- Ламарк, Дарвин и устройство науки. К недавнему юбилею «Философии зоологии» и «Происхождения видов» // Вестник РАН, 2010, № 8, с. 716-725.