Он руководил ботаническими садами в Роттердаме (1835—1846), Амстердаме (1846—1859) и Утрехте (1859—1871). С 1862 года возглавлял Государственный гербарий (нидерл. Rijksherbarium) в Лейдене.
Несмотря на то, что он никогда не совершал дальних путешествий, благодаря широким связям в научном ботаническом мире он собрал большую коллекцию растений Австралии и Нидерландской Ост-Индии. Он описал многие важные семейства растений Австралии и Индонезии, включая Казуариновые, Миртовые, Перечные и Гречишные.
Путь в науке
Отец Микеля, врач, был выходцем из юго-восточной Франции. Начальное образование Микель получил в семье.
Микель изучал литературу, а затем — с 1829 года — медицину и лекарственные средства в университете Гронингена, который окончил в 1833 году. Ещё будучи студентом, Микель увлёкся морфологией растений, напечатал несколько ботанических статей, удостоенных премии, первую свою ботаническую работу посвятил морфологии мхов и папоротников. Получив диплом врача и одновременно степень бакалавра естественных наук, работал врачом в больнице в Амстердаме.
В 1835 году он читал лекции о лекарственных средствах (особенно о лечебных травах) в клинической школе в Роттердаме. Жизнь в Роттердаме позволила ему сблизиться с миром учёных-ботаников, публиковать свои статьи по морфологии, геоботанике и систематике растений. Микель по слабости здоровья никогда не выезжал за пределы Европы, тем не менее, используя гербарии и живые растения, привезённые другими из-за границы, он описал флоры Новой Зеландии, Суринама, Восточной Индии, написал несколько монографий о родах растений. В 1846 году он был избран постоянным членом Академии наук, стал профессором ботаники в Амстердамском университете, где проработал 13 лет, читая, кроме всего, лекции по фармакологии, палеонтологии и даже геологии. В 1850 году по совокупности научных трудов ему была присуждена степень почётного доктора естественных наук.
В 1859 году он перешёл в Утрехтский университет, где также стал профессором ботаники (в этом звании он состоял до самой своей кончины), одновременно исполняя обязанности директора Утрехтского ботанического сада.
В 1862 года стал директором Государственного гербария в Лейдене. При нём коллекции растений постоянно пополнялись и содержались в образцовом порядке. Он заслужил славу заботливого попечителя ботанического наследия.
Поскольку правила Государственного гербария не позволяют директору иметь собственный гербарий, Микель был вынужден продать свой весьма обширный гербарий Утрехтскому университету (сейчас он включён в коллекцию Государственного гербария Нидерландов).
Микель провёл множество исследований по таксономии растений. Так, например, он описал флоры голландской Ост-Индии и Суринама. В общей сложности он описал около 7 000 ботанических таксонов. Для книги «Prodromus» О. Декандоля Микель обработал семейство Казуариновые, а для «Flora brasiliensis» Марциуса — Хлорантовые, Эбеновые, Мирзиновые, Перечные, Первоцветные, Симплоковые, Сапотовые и Крапивные. Его перу принадлежат 296 работ по самым различным вопросам ботаники, в том числе и палеоботаники. Он заметил сходство растений Японии и Северной Америки и развил теорию об общности происхождения флор этих двух регионов.