Служил приходским священником в Штайнхайме, деканом приюта во Франкфурте.
Основные сочинения Иоанна из Индагине посвящены астрологии — в них он отстаивает «естественную астрологию» (связанную исключительно с наблюдением за небесными телами) против астрологии спекулятивной. Ему же принадлежат труды по физиогномике и хиромантии. Итоговый труд Иоганна из Индагине «Introductiones apotelesmaticae in Physiognomiam, Astrologiam naturalem, Complexiones hominum, Naturas Planetarum» (1522) был крайне популярен в XVI—XVII вв., переведён на многие европейские языки и включён папой Павлом IV в 1559 г. в список запрещённых книг.
