Уроженец города Любека, был профессором математики в Гиссене и Ростоке, а с 1628 г. — ректором Иоганнеума в Гамбурге, где и умер. Юнг считается предшественником Лейбница в стремлениях к реформе в области философии. Ботаника обязана ему первой естественной группировкой растений, которую уже после его смерти, но по составленным под его диктовку запискам (так как сам он почти ничего не печатал) представил Joh. Vaget в сочинении: «Joachim Jungii isagoge phytoscopia etc.» (Гамбург, 1678) и позднее усовершенствовал Линней.
Большая часть трудов Юнга появилась в печати уже после его смерти. Главные из них:
