Наприкінці 1980-х Келлі почав робити роботи з поношених іграшок і в'язаних хусток. У 1987 він зробив «More Love Hours Than Can Ever Be Repaid», «Garbage Drawings» на основі коміксу Sad Sack в 1988. Добре прийняте в Лос-Анджелесі, мистецтво Келлі не користувалося успіхом в Нью-Йорку до виставки в 1988 у Metro Pictures. У 1993 художник був куратором «The Uncanny», виставки, присвяченої незвичайним інтерпретацій тіла для Sonsbeek '93 в Gemeentemuseum Arnhem в Нідерландах. Келлі співпрацював з багатьма художниками, наприклад, з Оурслером і Маккарті. У 1997-98 Келлі і Оурслер представили Poetics Project на «Документі».
У Келлі було багато персональних виставок, включаючи дві ретроспективи, організовані Музеєм Уїтні в Нью-Йорку (1993 - 94) і Museu d'Art Contemporani de Barcelona (1997). Серед багатьох групових виставок можна відзначити Бієнале Уїтні (1985, 1987, 1989, 1991, 1993, і 1995), Венеціанську Бієнале (1988 і1995), Carnegie International (1991), і «Документу» (1992 і 1997).
Для виставки L'Informe: Mode d'Emploi в 1996 у Центрі Помпіду в Парижі МайкКеллі представив інсталяцію з брудними м'якими іграшками, які були пришиті до висить на стіні тканини і розкидані на столах. Вони втілювали ідеї насильства і минущого, «злягаються іграшки» стали з того часу чимось на зразок торгової марки Келлі.
У 1995 Келлі почав псевдо-автобіографічний проект - «Educational Complex» (моделі інституцій, в яких коли-небудь навчався). Порожні частини моделей представляли «забуті» зони. Для Келлі ця робота відзначає початок серії проектів, в яких псевдо-автобіографічний, синдром витісненої пам'яті і ре-інтерпретація стають інструментами для деконструкції.
У 2007 МайкКеллі повернувся до теми пам'яті і популярної культури, досліджуючи їх через міф про загублене місто супермена - Кандор. Інсталяція Kandors (2007) заснована на історії супермена: його рідне місто колись був зменшений до мініатюри одним з антогонистов і тепер зберігається у пляшці. Келлі зробив моделі міста, засновані на різних зображеннях в коміксах. Все це в оточенні пляшок і проекцій на виствке нагадувало футуристичну лабораторію.
Нагороди та гранти
1987 Awards in the Visual Arts Grant
1990 National Endowment for the Arts Museum Program Exhibition Grant
1986 Artists Space Interarts Grant
2003 John Simon Guggenheim Memorial Foundation Fellowship
1998 The University of Michigan School of Art and Design Distinguished Alumnus Award
1985 Louis Comfort Tiffany Foundation Grant
1985 National Endowment for the Arts Visual Artists Fellowship Grant
2000 The California Institute of the Arts Distinguished Alumnus Award
