Опубликовал ряд важных работ о растениях и животных, а также классическую работу в традиции натуральной теологии — Мудрость Божия, явленная в деле творения (Wisdom of God, Manifested in the Work of Creation, 1691).
В 1670 году впервые получил муравьиную кислоту, «перегонкой» красных муравьёв.
В книге Methodus plantarum novae (1682) первым ввёл разделение растений на двудольные и однодольные и дал первую биологическую концепцию вида.
Полемизировал по вопросам классификации растений с Жозефом Питтоном де Турнефором и Августом Ривинусом.
Исследовал влияние света на окраску растений.
Известен также как собиратель английских пословиц и поговорок.
О нём
- Charles E. Raven. John Ray: Naturalist: His Life and Works, 1950
