Ранние годы
Родился в Мюнхене в семье врача Ханса-Августа Рашера. Третий ребёнок в семье.
В 1930 или 1931 году (данные двух дошедших до наших дней рукописных биографий разнятся) окончил школу в южногерманском городе Констанц. С 1933 года изучал медицину во Фрайбурге, где вступил в НСДАП. По разным версиям, это произошло 1 марта или 1 мая 1933 г. Сдав традиционный для немецкого медицинского образования экзамен после пятого семестра, после сдачи которого студент имеет право заниматься некоторыми видами медицинской деятельности, Рашер уезжает к отцу в Базель, где продолжает изучать медицину и работает по специальности. В 1934 году в Швейцарии он проходит трёхмесячную практику; в октябре того же года для продолжения обучения возвращается в Мюнхен. В этом городе в 1936 году сдаёт государственный медицинский экзамен и защищает кандидатскую диссертацию. В мае 1936 года вступает в СА.
В Мюнхене с 1936 по 1938 год. Рашер работает вместе с профессором Трамппом над проблемами диагностики рака. Получил стипендию «Общества взаимопомощи немецкой науки». Одновременно до 1939 года бесплатно работал ассистентом в хирургическом отделении больницы Мюнхенского университета. В январе 1939 года Рашер переходит из СА, где он к тому времени достиг звания «роттенфюрер» (старший ефрейтор), в СС.
Спутницей жизни Зигмунда Рашера в тот период была Каролина Диль, бывшая певица, вдова театрального режиссёра Оскара Диля. Каролина Диль была знакома с рейхфюрером СС Генрихом Гиммлером (во время борьбы НСДАП за власть она предоставляла ему убежище) и сохранила с ним хорошие личные отношения. По её просьбе 23 апреля 1939 года состоялась первая встреча Гиммлера и Рашера. Вскоре после этого 30-летний Зигмунд Рашер возглавил научное исследование «Ранний диагноз заболеваний раком».
Каролина Диль была старше Зигмунда Рашера на 16 лет и от их связи трудно было ожидать многочисленного потомства, что не соответствовало официальной политике Третьего рейха в области повышения рождаемости. Поэтому Гиммлер, а одобрение бракосочетания рейхсфюрером СС было обязательным для всех членов СС, не давал разрешения на заключение официального брака между Диль и Рашером. Однако, после того как Каролина Рашер в 1940 году родила второго ребёнка (первый был рождён годом ранее), пара всё-таки получила разрешение Гиммлера сыграть свадьбу. Рейхсфюрер СС благоволил растущей семье Рашеров: после рождения второго ребёнка они стали ежемесячно получать пособие в размере 165 рейхсмарок, кроме того, Гиммлер регулярно присылал им пакеты с фруктами, шоколадом и другими дефицитными в воюющей Германии продуктами. Каролина Диль, которая после свадьбы взяла фамилию мужа, в знак благодарности подарила Гиммлеру фотографию своей семьи. Этот снимок так нравился рейхсфюреру СС, что он даже приказал использовать его в качестве титульного листа для одного из учебных пособий СС.
В ходе своей работы в СС Рашер отправил в концлагерь собственного отца.
Учёная деятельность в СС
Исследования рака
1 мая 1939 года Зигмунд Рашер был принят в Аненербе. В тот же день он представляет Гиммлеру меморандум, в котором предлагает исследовать пять вопросов из области заболевания раком. Наряду с вопросами, которые были продолжением его мюнхенской работы, он должен был выяснить связь между использованием удобрений и возникновением рака у коров. Кроме того, Рашер, экспериментируя над белыми мышами, пытался выяснить возможности рака как инфекционного средства борьбы с грызунами. Также (по приказу Гиммлера) Рашер вёл долгосрочное наблюдение картины крови у «бессрочно арестованных» с тем, чтобы исследовать их заболевания с момента возникновения. Полученные таким способом научные открытия оказались ценным вкладом в развитии диагностики заболевания на ранней стадии. Это мероприятие противоречило существующим на тот момент официальным правилам: длительность предварительного заключения не устанавливалась, но каждые три месяца должен был рассматриваться вопрос о продлении заключения под стражу, поэтому «бессрочно арестованных» официально не существовало.
