Жизнеописание
В 1632—1634 годах участвовал в Смоленской войне, с 1642 года служил полковым воеводой Большого полка в Переяславле-Рязанском. В 1645—1646 годах приводил к присяге царю жителей городов Нижнего Поволжья и на Тереке. С 1646 по 1648 год — полковой воевода в Туле.
После начала русско-польской войны 1654—1667 годов был одним из руководителей войска, оперировавшего в Литве, участвовал во взятии Вильны и Ковно. В 1656 году пожалован Алексеем Михайловичем в бояре. После Виленского перемирия участвовал в войне со шведами и был главой русских дипломатических делегаций при заключении Валиесарского перемирия в 1658 году и Кардисского мира в 1661 году.
В 1657 и 1661—1666 годах руководил Владимирским судным приказом. Принимал участие в отражении наступления короля Яна Казимира в 1664 году. В битве под Мглином совместно с князьями Яковом Черкасским и Юрием Барятинским нанес тяжелое поражение королевской армии и захватил всю артиллерию противника. В 1667 году был послан воеводой в Астрахань, где спешно укрепил город и руководил его обороной при осаде отрядами Степана Разина. По приказу Прозоровского был казнён посланник Разина, потребовавший сдать город. Во время штурма города был ранен и со своими сторонниками заперся в соборе. После взятия Астрахани бунтовщиками был убит вместе со своим восьмилетним сыном Борисом. Сам Прозоровский был сброшен с кремлёвской башни, а сына повесили за ноги со стены кремля. Кончина Ивана Семёновича вместе с сыном от рук бунтовщиков прибавила роду Прозоровских авторитета при дворе и шесть племянников Прозоровского в разное время стали боярами при Петре I.
