В 1982 году окончила геологический факультет Московского государственного университета им. Ломоносова.
В 1995 году защитила кандидатскую, в 2000 году — докторскую диссертацию, руководила кафедрой физического материаловедения и лазерных технологий.
В 2007 году Астаповой Е. С. присвоено ученое звание профессора по кафедре физического материаловедения и лазерных технологий. С 2004 по 2007 гг. Астапова Е. С. занимала должность проректора по учебно-научной работе. С 29 декабря 2007 года — и. о. ректора Амурского государственного университета.
9 июня 2008 года приказом Федерального агентства по образованию № 12-01-02/86 утверждена в должности ректора Амурского государственного университета.
Астапова Е. С. проводит активную политику по развитию университета и взаимодействию с органами государственной власти. В АмГУ открыты новые специальности: «Налоги и налогообложение», «Таможенное дело», «Реклама», «Энергообеспечение предприятий», с 1 сентября 2009 г. осуществляется набор на новые магистерские образовательные программы: «Прикладная математика и физика», «Информатика и вычислительная техника». Начата подготовка специалистов для космодрома «Восточный».
Амурский государственный университет к 35-летнему юбилею добился значительных и признанных успехов. Это подтверждено результатами его государственного лицензирования, аттестации и аккредитации как учреждения высшего профессионального образования Российской Федерации.
