Вся профессиональная жизнь А.А.Майбороды на протяжении 44 лет связана с Иркутским государственным медицинским университетом, который он закончил в 1963 году и в этом же году был зачислен в аспирантуру при кафедре общей биологии. На кафедре биологии прошла вся последующая трудовая деятельность А.А. Майбороды. После окончания аспирантуры работал старшим научным сотрудником, а с 1967 года – заведующим морфологическим отделом Центральной научно-исследовательской лаборатории ИГМИ. Он все эти годы был заведующим кафедры общей биологии, читал лекции по гистологии и органической химии, а с 1976 года и по настоящее время является профессором – заведующим кафедрой биологии. В 1990 году коллективом института на альтернативной основе А.А.Майборода избирается ректором ИГМИ, в 2004 году избран почетным профессором, а в 2005 – почетным ректором ИГМУ.
Формирование А.А. Майбороды как ученого, педагога проходило на кафедре, где ранее трудился заслуженный деятель науки, профессор, доктор зоологии Петроградского университета, член-корреспондент Российской Академии наук, доктор философии Гейдельбергского университета В.Т.Шевяков. Позже доктор биологических наук, профессор, выпускник Казанского университета С.И.Тимофеев и доктор биологических наук, выпускница Иркутского государственного университета А.А.Линевич, а также выпускник ИГМИ, профессор В.А.Флоренцев. Руководители кафедры биологии ИГМИ сумели создать в коллективе атмосферу творчества, культа науки и систематического самосовершенствования.
Глубокий интерес к научной работе пробудила благодатная аура науки, сложившаяся на кафедре биологии у студента 1 курса санитарно-гигиенического факультета А.А.Майбороды. Все годы учебы в институте он самозабвенно трудился в студенческом кружке на кафедре биологии, выступал с докладами на конференциях студенческого научного общества института (СНО ИГМИ), межвузовских конференциях, неоднократно награждался почетными грамотами. Был председателем СНО ИГМИ и членом Всесоюзного общества анатомов, гистологов и эмбриологов.
Одним из главных направлений в научной деятельности А.А.Майбороды явилось изучение проблем воспаления. «Сравнительным морфологическим и гистохимическим аспектам асептического воспаления в языке некоторых представителей классов позвоночных» была посвящена кандидатская (1967) и «Органным и видовым особенностям воспаления у позвоночных» - докторская (1981) диссертации.
В исследованиях по воспалению А.А.Майборода настойчиво проводит этиологический принцип изучения механизмов воспаления в зависимости от реактивности организма и гормональных нарушений. Им рассмотрены особенности воспалительной реакции у позвоночных, развившихся в результате воздействия механического, химического и температурных факторов, токсических веществ, тяжелых металлов (свинец), кремнийсодержащей и фенопластовой пыли. Изучались органные особенности воспаления, формы клеточного взаимодействия и их регуляция в очаге асептического воспаления, а также особенности течения воспаления у человека в легких при воздействии минеральной пыли, в почечной ткани – свинца.
К оригинальным и приоритетным работам А.А.Майбороды относятся исследования влияния гормонов надпочечников, щитовидной и поджелудочной железы на клеточные реакции формообразования процесса в очаге воспаления, эндокринной регуляции формообразовательного процесса в очаге воспаления.
Научные интересы А.А.Майбороды ныне сконцентрированы на выяснении закономерностей клеточных реакций в очаге повреждения. Значение полученных данных и предлагаемых гипотез заключается в конкретизации и дальнейшем развитии представлений о воспалении как о частном случае клеточных взаимодействий о видонеспецифичности воспалительных реакций. По-новому освещается проблема органоспецифичности воспаления, механизм хронического воспаления и клеточной саморегуляции в очаге воспаления. Результатом комплекса исследований является разработка способа моделирования и количественной оценки хронического воспаления, что позволяет стандартизировать экспериментальный материал в процессе его обработки, создает возможность получить сведения о динамической структуре хронического воспаления и причинах хронизации. Предложен метод количественной оценки воспаления, который имеет международный приоритет и внедрен в практику научных лабораторий Китая, Японии и Монголии. Широко ведутся поиск и разработка моделей для изучения взаимодействий в системе «Паразит – хозяин». Решение этой проблемы осуществляется в рамках международного сотрудничества. Важным в практическом отношении являются работы А.А.Майбороды, посвященные гельминтозам, анализу структуры гельминтозов как природного очага озера Байкал, в частности дефиллоботлиоза на Малом море озера, описторхоза, токсокароза в Иркутской области и энтеробиоза в Монголии. В 1989г. А.А.Майбородой был организован научно-производственный отряд с участием студентов ИГМИ по обследованию, дегельминтизации и лечению больных описторхозом в районах Иркутской области.
