Первоначально получил образование архитектора в Лондоне в 1926 году. Занялся археологией, примал участие в раскопках в Тель эль-Амарне, в раскопках Мерсина под руководством Джона Гарстанга. Затем до 1948 года работал в Ираке, принимал участие в основании Иракского национального музея в Багдаде. Когда в 1948 году в Анкаре по инициативе Джона Гарстанга был создан Британский институт археологии, Сетон Ллойд стал его первым директором. В Турции тесно сотрудничал с молодым археологом Джеймсом Меллаартом, прославившимся открытием и раскопками Чатал-Гуюка. Совместно с Меллаартом принимал участие в раскопках Бейджесултана. С 1961 года до ухода на пенсию работал в Лондонском университете.
Публикации на русском языке
- Сетон Ллойд. Археология Месопотамии. — Москва: Наука, 1984. — 279 с. — (По следам исчезнувших культур Востока).
- Сетон Ллойд. Реки-близнецы. — Наука, 1972. — 239 с. — (По следам исчезнувших культур Востока). — 15000 экз.