А. Ле Фоконье родился в семье врача, близ Кале. В 1901 году приезжает в Париж, учится в мастерскоей художника Ж.-П.Лорана, в 1906 году поступает в Академию Жюлиана. С 1905 Ле Фоконье выставляет свои картины в Салоне Независимых. В 1908 он проводит год в Плуманаше, в Бретани, где много рисует. В 1909 знакомится с художниками Альбером Глезом и Робером Делоне. В 1910 году Ле Фоконье вступает в Новый союз художников Мюнхена и совершает путешествие по Италии.
В 1912 художник участвует в выставке Художественного музея Хагена; к каталогу выставки он пишет вступление. В этом же году он становится руководителем парижской Академии палитры. В том же 1912-м Ле Фоконье женится на Марии Баранниковой. Во время Первой мировой войны он находится в Нидерландах (до 1919 года), так как не желает служить во французской армии. В 1920 вернулся в Париж. С 1923 года каждое лето проводил в Гросрувре близ Парижа, в арендованном доме. Здесь же и умер от инфаркта; тело художника обнаружили лишь через 2 недели после его смерти. Похоронен в Париже.
Художественное творчество Де Фоконье пережило несколько различных фаз. Начинал он как неоимпрессионист (1905—1907), затем последовал бретонский период наби и фовизма (1908). Третьим была для художника эпоха кубизма (1909—1913), которому следовал голландский период в экспрессионистском стиле (1914—1919). Наибольшей известности Ле Фоконье достиг своими кубистскими и футуристическими работами, созданными в канун Первой мировой войны. Картины его, написанные в Нидерландах, указывают на усиливающееся значение цветовой гаммы. Послевоенные же полотна несут на себе трезвый, реалистический отпечаток.
