Родился в Гессене или в Эрфурте. Учился сперва у своего отца, затем в Марбургском университете, который окончил в 1531 г. (то есть в возрасте 16 лет). В последующие годы работал в Лейпциге в аптеке своего дяди, одновременно посещая занятия в местном университете. С 1539 г. преподавал в университете Виттенберга; материалы лекций Кордуса по ботанике были изданы уже после его смерти, в 1549 г. под названием «Замечания к Диоскориду» (лат. «Valerii Cordi Simesusii annotationes in Pedacii Dioscoridis Anazarbei de medica materia...»), поскольку Кордус, как и все ботаники его времени, опирался на труд Диоскорида «О лекарственных веществах».
В 1540 г. Кордус открыл и описал революционную технологию получения эфира из серной кислоты и этилового спирта.
В 1542 г. Кордус представил городскому совету Нюрнберга свой основной труд по фармакологии (лат. «Valerii Cordi dispensatorium, sive pharmacorum conficiendorum ratio»), за который и получил сто золотых монет; этот труд был издан Нюрнбергским муниципалитетом в 1546 г. и многократно переиздавался.
Другой основной труд Кордуса, всеобъемлющий справочник по растениям Италии и Германии «История растений» (лат. «Historia Plantarum»), был представлен им в 1544 г. в Виттенбергский университет — за него Кордус получил степень доктора медицины. Вскоре после этого Кордус умер от малярии во время одной из своих многочисленных поездок по Европе. Многие его работы были опубликованы посмертно Конрадом Геснером.
