Закончил Томский государственный университет в 1977 году по специальности преподаватель химии и биологии. Кандидат философских наук. Диссертацию по теме «Циклические процедуры научного исследования» защитил в Новосибирском государственном университете в 1988 году. Профессор, заведующий кафедрой местного самоуправления Государственного университета — Высшая школа экономики с 2008.
Принимал участие в организации неформального объединения учёных, проводивших семинары по экономическим проблемам в ЦЭМИ АН СССР. Являлся активным участником семинаров и рабочих групп по формированию стратегии рыночных и либеральных реформ в России. Генеральный директор Центра проблем гражданского общества и частной собственности с 1993. Начальник Экспертного управления Администрации Президента РФ в 2000—2004. Старший референт Президента РФ в 2004—2005. Действительный государственный советник Российской Федерации 1 класса.
С. Кордонский — один из создателей направления, именуемого «теорией административного рынка». Автор монографий: «Рынки власти (административные рынки СССР и России)» (ISBN 5942823596), «Циклы деятельности и идеальные объекты» (ISBN 5921800004X), «Сословная структура постсоветской России» (ISBN 9785939470254), «Россия. Поместная федерация» (ISBN 9785973901929) и других.
Ввёл в научное обращение понятие «веерных матриц».
В западной прессе цитируются его высказывания типа:
- "функция детдома в России - подготовить маргинализированных членов общества к карьере профессиональных воров и грабителей"
- "люди в России являются ресурсополучателями, а не гражданами"
- "иностранное для россиян символизирует жизнь в раю и что россияне хотят не стать гражданами, а просто жить в раю"
А у господина Кордонского не было родителей вообще?Он что,инкубаторский?