После смерти матери в 1728 году Карл Теодор в 4-летнем возрасте наследовал титул маркграфа Бергена-оп-Зом, маленького городка в Северном Брабанте. Через 5 лет умер его отец и маленький Карл Теодор стал пфальцграфом Зульцбахским. 31 декабря 1742 года умер курфюрст Пфальцский Карл III Филипп, последний представитель линии пфальцграфов Нёйбургских династии Виттельсбахов и титул курфюрста перешёл в следующую по старшинству линию этого дома пфальцграфов Зульцбахских. Так Карл Теодор стал курфюрстом Пфальца под именем Карл IV. Вместе с титулом курфюрста к нему перешёл также титул герцога Юлих и Берг (см. Юлих-Берг). И наконец в 1777 после смерти последнего курфюрста Баварии из баварской линии Виттельсбахов Максимилиана III Иосифа Карл Теодор стал курфюрстом и герцогом Баварии под именем Карл II и переехал в Мюнхен.
Карл IV Теодор похоронен в крипте Театинеркирхе в Мюнхене.
