Родился в 1829 г. в Великом княжестве Финляндском. Воспитывался в Финляндском кадетском корпусе, по окончании которого в 1847 г. был выпущен прапорщиком в лейб-гвардии Семёновский полк.
В следующем году ему пришлось принять участие с этим полком в походе к нашим западным границам по случаю Венгерской кампании.
С этим же полком, в котором Эттер прослужил более двадцати лет, сделал он и следующую кампанию 1863—1864 гг. в Виленский военный округ для подавления польского мятежа.
В 1865 г. Эттер был произведён в полковники и 26 ноября того же года назначен флигель-адъютантом. В следующем году он назначен был командиром лейб-гвардии Финского стрелкового батальона, с оставлением флигель-адъютантом. Финским батальоном Эттер командовал восемь лет и в течение этого времени был произведён в генерал-майоры (30 августа 1869 г., с оставлением в Свите).
В 1874 г. ему вверен был в командование лейб-гвардии Семёновский полк, а вслед за тем и 2-я бригада 2-й гвардейской пехотной дивизии. Тогда же он был зачислен в списки лейб-гвардии Финского стрелкового батальона.
В Турецкой кампании 1877—1878 гг. Эттер со своей 2-й бригадой 2-й гвардейской дивизии принял самое деятельное участие. За храбрость и распорядительность, оказанные им в эту кампанию, особенно при переходе через Балканы и при взятии Филиппополя, он был награждён золотой саблей с надписью «За храбрость», такой же саблей, украшенной бриллиантами, и орденом св. Анны 1-й степени с мечами и бантом.
По возвращении из Турции Эттер продолжал командовать 2-й бригадой 2-й гвардейской дивизии до 30 августа 1881 г., когда был произведён в генерал-лейтенанты и назначен начальником 1-й гренадерской дивизии. Эту должность он занимал до самой своей смерти.
Кроме вышеупомянутых знаков отличия, Эттер имел еще ордена св. Станислава 1-й степени и св. Владимира 3-й степени, а также несколько иностранных орденов, полученных им во время службы флигель-адъютантом.
Умер Эттер в Москве 28 января 1883 г.
Сын Севастьяна Павловича, Иван Севастьянович, во время Первой мировой войны командовал лейб-гвардии Семёновским полком и за отличие был награждён орденом св. Георгия 4-й степени. Также у Севастьяна Павловича было два брата: Николай и Павел, они тоже служили в русской императорской армии в генеральских чинах.
