В данный момент работает в Санкт-Петербургском государственном университете экономики и финансов (заведующий кафедрой романских языков и перевода), а также на факультете свободных искусств и наук (руководитель программы «Французские исследования»)
Научными интересами Фокина являются: история французской литературы XIX-XX веков, французская философия XX века, франко-российские литературные связи, теория, история и критика перевода.
Научные труды
- Альбер Камю. Роман. Философия. Жизнь. — СПб., «Алетейя», 1999;
- Философ-вне-себя. Жорж Батай. СПб., Издательство Олега Абышко, 2002;
- «Русская идея» во французской литературе XX века. — СПб., Издательский дом С.-Петербургского университета, 2003;
- Наваждения. К истории «русской идеи» во французской литературе XX века. Материалы российско-французского коллоквиума. М., Наука, 2005;
- Ж.-П. Сартр в настоящем времени. Автобиографизм в литературе, философии и политике. Материалы международной конференции. СПб., Издательство Санкт-Петербургского университета, 2006.
Фокиным таже выполнены переводы (с предисловиями и комментариями) книг: Ж. Батая, Ж. Делёза, П. Дриё Ла Рошеля, М. Лейриса, Ж.-П. Сартра, Ж.-Л Нанси и Ф. Лаку-Лабарта, А. Роб-Грийе, М. Сюриа.
В период с 21 по 22 апреля 2008 года Сергеем Лонидовичем Фокиным была проведена международная конференция «Шарль Бодлер и Вальтер Беньямин. Эстетика и политика».
