Семья и образование
Родился в семье священника. Окончил Волынскую духовную семинарию (1906), Московскую духовную академию (1910) со степенью кандидата богословия.
Монах и священник
Во время учёбы в академии был пострижен в монашество, рукоположён в иеродиакона и иеромонаха.
С 1910 года — противосектантский миссионер Черниговской епархии.
С 1911 года — противосектантский миссионер Киевской епархии.
С 1915 года — архимандрит и ректор Нью-Йоркской духовной семинарии в США.
Начало архиерейского служения
С 6 августа 1916 года — епископ Аляскинский.
В 1917 года вернулся в Россию, был участником Поместного собора 1917—1918.
В 1917—1919 годах жил в Москве, оставаясь епископом Аляскинским.
В апреле — октябре 1919 года временно управлял Смоленской епархией.
С 19 октября 1920 года — епископ Смоленский.
Первые аресты
В 1921 был приговорён к двум годам условного заключения и к высылке из Западной области по обвинению в хранении контрреволюционной литературы. 9 мая 1922 вновь был арестован по этому же обвинению, в июне 1922 дело было прекращено, но сразу же возбуждено новое — о сопротивлении изъятию церковных ценностей. Был отправлен в Москву, содержался в Бутырской тюрьме, в августе 1922 освобождён.
В 1922, после освобождения из заключения, недолго вынужденно примыкал к обновленческому движению. Но уже 18 декабря 1922 года обновленческое руководство приняло решение о его переводе из Смоленска в Крым. Не подчинился этому указу, удалился на покой, в январе — апреле 1923 жил в Ордынской пустыни Демидовского уезда Смоленской губернии. После покаяния вернулся в Патриаршую церковь.
23 апреля 1923 года вновь арестован, обвинён в рукоположении во священники бывших офицеров колчаковской армии. Находился под стражей в Смоленске и Москве, был оправдан, но в июне 1923 выслан на три года в Самарскую губернию. В 1925 владыке Филиппу по состоянию здоровья было разрешено переехать на Кавказ, где он оставался до 1928.
Астраханский архиерей
С 13 июня 1928 — епископ Астраханский, с 1929 — архиепископ. Занимался обучением верующих общенародному пению, боролся с «безобразным театральным пением» в храмах, противоречащим православной традиции. Отказался от какого-либо сотрудничества с обновленческим епархиальным управлением.
26 сентября 1929 был арестован. В газете «Коммунист» была опубликована статья, в которой архиепископ был обвинён в создании контрреволюционной организации, а также содержались многочисленные нападки личного характера. В ответ владыка Филипп заявил:
3 января 1930 приговорён к ссылке на три года в Северный край. По воспоминаниям современников, 1 марта 1930 многие верующие астраханцы пришли проводить своего владыку: у вокзала огромный пустырь за железнодорожными путями был заполнен людской толпой.
Жизнь в ссылке
Находился в ссылке в деревне Чукчино Усть-Цыльмского района Коми области, где написал для своих духовных чад руководство в духовной жизни: «Путь и истина, и жизнь», которое было переслано в Астрахань. Направлял письма своей пастве, в одном из которых, в частности, говорилось:
В 1931 году ему был вынесен новый, более строгий, приговор — к пяти годам ссылки в Омский край. 30 августа 1933 года был официально уволен на покой.
С 23 февраля 1937 — архиепископ Омский. В августе того же года был арестован и вновь сослан. С 1940 жил у своих сестёр в городе Борисоглебске Московской области, где работал лесным сторожем.
Вновь на Астраханской кафедре
В ноябре 1943 года был назначен архиепископом Иркутским, но ещё до выезда в епархию получил новое назначение по просьбе астраханских верующих, хотевших, чтобы он вернулся к управлению их епархией. С декабря 1943 — архиепископ Астраханский и Сталинградский.
