В двадцать лет вступил в Общество Иисуса. В 1972 был году рукоположен в сан священника. В 1975 защитил диссертацию по теме «Экклезиология Ханса Урса фон Бальтазара» в Университете Регенсбурга и получил степень доктора богословия. Его научным руководителем был Йозеф Ратцингер.
Впоследствии преподавал в иезуитском Университете Сан-Франциско, в котором в 1976 г. основал Институт св. Игнатия, который включает 150 студентов из 7000 общего числа учащихся. В последствии Институт св. Игнатия был разогнан противоположно настроенным руководством университета. После разгона института, под его началом был создал Кэмпион-колледж. В марте 2002 г. Дж. Фессио был сослан в пригород Лос-Анджелеса на место помощника больничного капеллана (причины неизвестны), однако в июне того же года ему было позволено орденом возвратиться к педагогической деятельности. Был назначен канцлером Университета «Ave Maria» в Мичигане. В 1995 году Фессио был одним из основателей Общества обновления Священной Литургии «Adoremus».
