На службе в германской армии с 1897 года, выполнял военные миссии в странах Востока — Турции, Японии, Китае.
В 1937 году, когда Германия поддержала агрессию Японии против Китая, Фалькенхаузен (в то время возглавлявший военную миссию при Чан Кайши) не поддержал агрессию и был отозван под угрозой ареста его семьи, вскоре уволен в отставку. В 1938 году Фалькенхаузен возвращён на военную службу, воевал на Западном фронте, с 1940 года — генерал-губернатор оккупированной Бельгии. Дружил с участниками антигитлеровского заговора Гёрделером и Вицлебеном, после провала их заговора находился в различных концлагерях, освобождён американцами в 1945 году.
В 1948 году отправлен в Бельгию, где привлечён к суду, в марте 1951 года приговорён к 12 годам заключения, однако уже через несколько недель помилован и освобождён, после того, как были представлены свидетельства его личного участия в спасении многих евреев от депортации в лагеря смерти.
В 1950 году получил личное поздравление и чек на 1 миллион долларов от Чан Кайши как «друг Китая».
