В 1501/2 г. его отец Султан-Ахмад-хан I, отправляясь на помощь старшему брату Султан-Махмуд-хану I против Мухаммеда Шейбани, передал управление Восточным и Центральным Моголистаном, а также Турфанским округом Мансуру. Ставка Мансура располагалась в Турфане.
В 1504 г. после смерти Султан-Ахмад-хана I дуглаты во главе с мирзой Аба Бакром вытеснили Мансура из Центрального Моголистана и захватили г. Аксу. В 1508 г. после убийства Султан-Махмуд-хана I Мансур вступил в борьбу за власть со своими братьями Султан-Халилом и Султан-Саидом. В том же году он разбил их в битве при Чарун-Чулане близ Алматы (Султан-Халил бежал в Фергану, где был убит по приказу Шейбани, а Султан-Саид отправился в Кабул) и утвердился в качестве единственного хана Моголистана, который включал в себя лишь Восточную часть, Турфан и Чалыш.
В 1516 г. состоялась встреча Мансур-хана с братом Султан-Саид-ханом, который, завоевав к тому времени Кашгар, Яркенд и исконные земли дуглатов Манглай-Субе, создал на этой территории независимое ханство Мамлакат-и Моголийе. Султан-Саид-хан признал старшего брата верховным ханом, обязался чеканить монету с его именем и упоминать его в хутбе.
В 1522 г. откочевавшие из улуса мангытов узбек-казаки вытеснили его из Восточного Моголистана. В 30-х годах неоднократно безуспешно пытался отвоевать Аксу у Абд ар-Рашид-хана I. В 1542/3 г. Мансур-хан назначил наследником своего сына Шах-хана и фактически отошел от дел правления ханством, которое к этому моменту состояло лишь из Турфанского округа.
